[测焦] PANGOLin的7月更新 (5/?)
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XBB家族(22F “狮鹫/Gryphon”)
XBB.1系列 “骏鹰/Hippogryph”
XBB.1.17.1的ORF1b:V2236I(G20173A)分支上,得到阶位S:K356T(A22629C)附带ORF1a:N1080D(A3503G), ORF1a:S2553F(C7923T)的分支被命名为GA.4(XBB.1.17.1.4),可能源自尼日利亚,正在欧美扩散;同一分支上的nt:T23797C子分支被命名为GA.5(XBB.1.17.1.5),主要来自欧洲;同一分支上的ORF1a:I2138V(A6677G), nt:G8785A子分支被命名为GA.6(XBB.1.17.1.6),可能源自加纳,在欧洲扩散,后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带ORF10:Q29*(C29642T), nt:A19767G的分支被命名为GA.6.1,主要来自大漂亮。
XBB.1.28.1的ORF1a:D2627N(G8144A), nt:C8140T, nt:T8141C, nt:A29320G分支被命名为FW.3(XBB.1.28.1.3),主要来自俄罗斯和印尼。
XBB.1.42的nt:C6040T, nt:G9049A分支被定义为XBB.1.42.2,疑似田园株;后继获得趋同S:E583D(G23311C)以及nt:C2143T的分支被命名为HL.1(XBB.1.42.2.1),主要来自加麻大。获得S:S929N(G24348A)附带ORF1a:P1950H(C6114A)的分支被命名为HL.2(XBB.1.42.2.2),船新的田园株。
XBB.1.9系列 “土卫七/Hyperion”
FL.2.3(XBB.1.9.1.2.3)得到阶位S:K356T(A22629C)附带nt:A11188G, nt:C27128T的分支被命名为FL.2.3.1,船新的田园株,由于广东两个月没传测序,不知道该毒株的具体扩散情况。
FL.13(XBB.1.9.1.13)的nt:T19110C分支被命名为FL.13.3,后继获得ORF1a:M902V(A2969G), S:E154Q(G22022C)的分支被命名为FL.13.3.1,主要来自带嘤。
EG.5.1(XBB.1.9.2.5.1)的ORF1b:V1644I(G18397A)分支被命名为EG.5.1.2,主要来自小日子,香港有测序记录;ORF1a:R542C(C1889T), nt:C22570T分支被命名为EG.5.1.3,主要来自大漂亮;ORF1b:K2557R(A21137G)分支被命名为EG.5.1.4,国内有测序记录;ORF1a:L3293I(C10142A), ORF1b:T1274I(C17288T), ORF1b:L2349V(T20512G), nt:G199A, nt:C29870A小型跃迁分支被命名为EG.5.1.5,主要来自伊比利亚半岛;携带趋同突变S:F157L(C22033A)以及ORF1a:S1857L(C5835T)的分支被命名为EG.5.1.6,主要来自大漂亮。
田园株、现任毒王EG.5.1.1的S:G257V(G22332T)分支被命名为HK.1(EG.5.1.1.1)。说起来在欧洲流行的XBB.1.5.26的分支被命名为EU.1,在带嘤流行的XBB.1.5.46的分支被命名为GB.1,一定都是巧合啦;携带S:Q14H(G21604T)的分支被命名为HK.2(EG.5.1.1.2);携带版本答案之一S:L455F(G22927T)的分支被命名为HK.3(EG.5.1.1.3),成为又一款具备S:L455F与S:F456L强力组合的毒株;携带趋同S:T883I(C24210T)的分支被命名为HK.4(EG.5.1.1.4);携带FCS邻近区段S:Q677H(G23593C)的分支被命名为HK.5(EG.5.1.1.5)。看到这些刚被命名的分支大概就能意识到为什么EG.5.1.1势头这么猛了,本身就强力的同时,后继分支抓到的都还是版本热门的强力增幅。
XBB.1.22系列 '参宿五/Bellatrix'
FY.2(XBB.1.22.1.2)改变了FCS的S:A684V(C23613T),附带ORF1a:T1874I(C5886T), nt:A28699G的分支被命名为FY.2.1,主要来自东南亚,它的一个后续分支还获得了趋同S:A348S(G22604T)。
FY.4.1获得了趋同S:S704L(C23673T)的分支被命名为FY.4.1.1,源自肯尼亚,可能扩散到低测序密度地区,最近不时被机场抽检截获。
XBB.1.22.1的S:D228E(T22246G), S:G769A(G23868C), S:D1168E(C25066A), ORF3a:P42L(C25517T), nt:A8347G, nt:C11674T, nt:C24442T, nt:A25974G, nt:C27429T, nt:C28603T跃迁分支被命名为FY.7(XBB.1.22.1.7),主要来自奥地利。
XBB.1.5家族 (23A “章鱼海怪/Kraken”)
nt:T17124C 分支
XBB.1.5.30的S:N481K(T23005A), ORF3a:L15F(G25437T), ORF7a:V74A(T27614C), nt:C17010T, nt:C24358A分支被命名为HM.1(XBB.1.5.30.1),主要来自加麻大。自此H字头已经用掉一半了。
GN.1(XBB.1.5.73.1)被拆分,XBB.1.5.73的ORF1a:T3356I(C10332T), ORF3a:G18V(G25445T), nt:C7834T分支下的S:F456L(T22928C)被分割出来作为GN.1的定义。同一分支下的ORF3a:A99G(C25688G)被定义为GN.2(XBB.1.5.73.2),主要来自秘鲁与加麻大。
GN.1(XBB.1.5.73.1)下的ORF1b:A1643V(C18395T)被定义为GN.1.1,秘鲁特产。
XBB.1.5.73的nt:C27143T分支被定义为GN.3(XBB.1.5.73.3),秘鲁特产;ORF1a:Q3966L(A12162T)分支被命名为GN.4(XBB.1.5.73.4),主要来自美洲;ORF1a:L1110I(C3593A), ORF1a:S4135F(C12669T)分支被命名为GN.5(XBB.1.5.73.5),主要来自秘鲁与加麻大。
HD.1(XBB.1.5.93.1)得到阶位S:K356T(A22629C)的分支被命名为HD.1.1,来自多米尼加共和国。
nt:T17124C 分支的 nt:T10204C 子分支
FT.1(XBB.1.5.39.1)进行拆分,在XBB.1.5.39的ORF1a:S538L(C1878T)分支上,获得S:I197V(A22151G)的为拆分后的FT.1;同一分支上获得S:K1045N(G24697T), nt:A21390G的被命名为FT.2(XBB.1.5.39.2),主要来自大漂亮。
XBB.1.5.39得到热门趋同S:Q52H(G21718T)的分支被命名为FT.3(XBB.1.5.39.3);后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带S:D1168H(G25064C), nt:C6628T, nt:A18366G的分支被命名为FT.3.1,该分支还有继续获得趋同S:A348S(G22604T)的后代,也是一个连续抓到版本答案的赌怪,主要来自北美。
XBB.1.5.39得到S:E180Q(G22100C)的分支被命名为FT.4(XBB.1.5.39.4),与XBB.1.16携带的减益S:E180V(A22101T)不同,S:E180Q在XBB.1.5的骨架上,按照Bloom与Neher老师的预计能略微提升适应性。主要来自杈国。
XBB.1.16家族 23B '大角星/Arcturus'
XBB.1.16得到趋同S:E554K(G23222A)的分支被命名为XBB.1.16.17,源自印度,在纽村扩散。说起来印度最近公开的测序不多,在INSACOG上看到的毒株分布状况,BA.2*又开始回潮了,不知这是测序质量不行呢,还是又养出蛊了。
本期附赠XBB.1.9家族种子选手图谱。其中FL.2.3.1、FL.2.4、FL.4.2、FL.13.1、FL.13.2、FL.16、EG.4.2、EG.5.1.1、HK.1、HK.2、HK.3、HK.4、HK.5都是田园株,大部分都在天梯榜的前列。
#AnythingButCovid##新冠变种扩散跟踪##CovidDiversity##好日子在后头呢#
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XBB家族(22F “狮鹫/Gryphon”)
XBB.1系列 “骏鹰/Hippogryph”
XBB.1.17.1的ORF1b:V2236I(G20173A)分支上,得到阶位S:K356T(A22629C)附带ORF1a:N1080D(A3503G), ORF1a:S2553F(C7923T)的分支被命名为GA.4(XBB.1.17.1.4),可能源自尼日利亚,正在欧美扩散;同一分支上的nt:T23797C子分支被命名为GA.5(XBB.1.17.1.5),主要来自欧洲;同一分支上的ORF1a:I2138V(A6677G), nt:G8785A子分支被命名为GA.6(XBB.1.17.1.6),可能源自加纳,在欧洲扩散,后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带ORF10:Q29*(C29642T), nt:A19767G的分支被命名为GA.6.1,主要来自大漂亮。
XBB.1.28.1的ORF1a:D2627N(G8144A), nt:C8140T, nt:T8141C, nt:A29320G分支被命名为FW.3(XBB.1.28.1.3),主要来自俄罗斯和印尼。
XBB.1.42的nt:C6040T, nt:G9049A分支被定义为XBB.1.42.2,疑似田园株;后继获得趋同S:E583D(G23311C)以及nt:C2143T的分支被命名为HL.1(XBB.1.42.2.1),主要来自加麻大。获得S:S929N(G24348A)附带ORF1a:P1950H(C6114A)的分支被命名为HL.2(XBB.1.42.2.2),船新的田园株。
XBB.1.9系列 “土卫七/Hyperion”
FL.2.3(XBB.1.9.1.2.3)得到阶位S:K356T(A22629C)附带nt:A11188G, nt:C27128T的分支被命名为FL.2.3.1,船新的田园株,由于广东两个月没传测序,不知道该毒株的具体扩散情况。
FL.13(XBB.1.9.1.13)的nt:T19110C分支被命名为FL.13.3,后继获得ORF1a:M902V(A2969G), S:E154Q(G22022C)的分支被命名为FL.13.3.1,主要来自带嘤。
EG.5.1(XBB.1.9.2.5.1)的ORF1b:V1644I(G18397A)分支被命名为EG.5.1.2,主要来自小日子,香港有测序记录;ORF1a:R542C(C1889T), nt:C22570T分支被命名为EG.5.1.3,主要来自大漂亮;ORF1b:K2557R(A21137G)分支被命名为EG.5.1.4,国内有测序记录;ORF1a:L3293I(C10142A), ORF1b:T1274I(C17288T), ORF1b:L2349V(T20512G), nt:G199A, nt:C29870A小型跃迁分支被命名为EG.5.1.5,主要来自伊比利亚半岛;携带趋同突变S:F157L(C22033A)以及ORF1a:S1857L(C5835T)的分支被命名为EG.5.1.6,主要来自大漂亮。
田园株、现任毒王EG.5.1.1的S:G257V(G22332T)分支被命名为HK.1(EG.5.1.1.1)。说起来在欧洲流行的XBB.1.5.26的分支被命名为EU.1,在带嘤流行的XBB.1.5.46的分支被命名为GB.1,一定都是巧合啦;携带S:Q14H(G21604T)的分支被命名为HK.2(EG.5.1.1.2);携带版本答案之一S:L455F(G22927T)的分支被命名为HK.3(EG.5.1.1.3),成为又一款具备S:L455F与S:F456L强力组合的毒株;携带趋同S:T883I(C24210T)的分支被命名为HK.4(EG.5.1.1.4);携带FCS邻近区段S:Q677H(G23593C)的分支被命名为HK.5(EG.5.1.1.5)。看到这些刚被命名的分支大概就能意识到为什么EG.5.1.1势头这么猛了,本身就强力的同时,后继分支抓到的都还是版本热门的强力增幅。
XBB.1.22系列 '参宿五/Bellatrix'
FY.2(XBB.1.22.1.2)改变了FCS的S:A684V(C23613T),附带ORF1a:T1874I(C5886T), nt:A28699G的分支被命名为FY.2.1,主要来自东南亚,它的一个后续分支还获得了趋同S:A348S(G22604T)。
FY.4.1获得了趋同S:S704L(C23673T)的分支被命名为FY.4.1.1,源自肯尼亚,可能扩散到低测序密度地区,最近不时被机场抽检截获。
XBB.1.22.1的S:D228E(T22246G), S:G769A(G23868C), S:D1168E(C25066A), ORF3a:P42L(C25517T), nt:A8347G, nt:C11674T, nt:C24442T, nt:A25974G, nt:C27429T, nt:C28603T跃迁分支被命名为FY.7(XBB.1.22.1.7),主要来自奥地利。
XBB.1.5家族 (23A “章鱼海怪/Kraken”)
nt:T17124C 分支
XBB.1.5.30的S:N481K(T23005A), ORF3a:L15F(G25437T), ORF7a:V74A(T27614C), nt:C17010T, nt:C24358A分支被命名为HM.1(XBB.1.5.30.1),主要来自加麻大。自此H字头已经用掉一半了。
GN.1(XBB.1.5.73.1)被拆分,XBB.1.5.73的ORF1a:T3356I(C10332T), ORF3a:G18V(G25445T), nt:C7834T分支下的S:F456L(T22928C)被分割出来作为GN.1的定义。同一分支下的ORF3a:A99G(C25688G)被定义为GN.2(XBB.1.5.73.2),主要来自秘鲁与加麻大。
GN.1(XBB.1.5.73.1)下的ORF1b:A1643V(C18395T)被定义为GN.1.1,秘鲁特产。
XBB.1.5.73的nt:C27143T分支被定义为GN.3(XBB.1.5.73.3),秘鲁特产;ORF1a:Q3966L(A12162T)分支被命名为GN.4(XBB.1.5.73.4),主要来自美洲;ORF1a:L1110I(C3593A), ORF1a:S4135F(C12669T)分支被命名为GN.5(XBB.1.5.73.5),主要来自秘鲁与加麻大。
HD.1(XBB.1.5.93.1)得到阶位S:K356T(A22629C)的分支被命名为HD.1.1,来自多米尼加共和国。
nt:T17124C 分支的 nt:T10204C 子分支
FT.1(XBB.1.5.39.1)进行拆分,在XBB.1.5.39的ORF1a:S538L(C1878T)分支上,获得S:I197V(A22151G)的为拆分后的FT.1;同一分支上获得S:K1045N(G24697T), nt:A21390G的被命名为FT.2(XBB.1.5.39.2),主要来自大漂亮。
XBB.1.5.39得到热门趋同S:Q52H(G21718T)的分支被命名为FT.3(XBB.1.5.39.3);后续获得热门趋同S:T478R(C22995G)附带S:D1168H(G25064C), nt:C6628T, nt:A18366G的分支被命名为FT.3.1,该分支还有继续获得趋同S:A348S(G22604T)的后代,也是一个连续抓到版本答案的赌怪,主要来自北美。
XBB.1.5.39得到S:E180Q(G22100C)的分支被命名为FT.4(XBB.1.5.39.4),与XBB.1.16携带的减益S:E180V(A22101T)不同,S:E180Q在XBB.1.5的骨架上,按照Bloom与Neher老师的预计能略微提升适应性。主要来自杈国。
XBB.1.16家族 23B '大角星/Arcturus'
XBB.1.16得到趋同S:E554K(G23222A)的分支被命名为XBB.1.16.17,源自印度,在纽村扩散。说起来印度最近公开的测序不多,在INSACOG上看到的毒株分布状况,BA.2*又开始回潮了,不知这是测序质量不行呢,还是又养出蛊了。
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继丰田陆巡(兰德酷路泽)、雷克萨斯GX之后,外媒曝光了全新一代丰田霸道(普拉多)的相关信息,作为经典硬派越野车,换代后的霸道同样源自TNGA架构GA-F平台,采用非承载式车身+整体桥后悬设计,并且也会提供标准版和GR SPORT运动版可选。而在动力方面,燃油版将主打2.4T L4涡轮增压发动机,并提供搭载4.0T V6自吸发动机、3.5T V6涡轮增压发动机的版本可选,除此之外,新车还将推出以2.4T发动机、8AT变速器为基础混动车型。另悉,新一代霸道会继续由一汽丰田在成都工厂投产,整车平台架构搭建部分问题不大,重点是这套2.4T发动机的国产化问题。
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