连接酶的常见种类和作用机制
1、T4DNA连接酶
T4DNA连接酶是目前应用比较多的病毒基因组编码的DNA连接酶,在基因重组中广泛使用。噬菌体类型较多,目前研究发现T4噬菌体能够合成T4DNA连接酶,并且已经能够从被T4嗜菌体感染的大肠杆菌中提取该酶,此外科学家也已经定位该酶的合成基因,即噬菌体T4的30基因。T4DNA连接酶具有连接黏性末端和平末端的作用,研究人员总结DNA片段的连接过程,认为整个DNA连接反应可以通过三个连续步骤来完成:
(1)ATP通过断裂最后一个高能磷酸键释放能量,同时产生的AMP和T4DNA连接酶利用ATP水解释放的能量形成E-AMP复合物;
(2)所形成的E-AMP复合物可以识别DNA双链之前被切开的切口,识别之后AMP会脱离E-AMP复合物并与DNA的5’-P基团结合;
(3)需要连接的另外一段DNA分子片段的3’-OH会攻击第二步形成5’-P-AMP,3’-OH和磷酸基团残基发生反应形成磷酸二酯键,同时释放出一个AMP。
2、 真核生物DNA连接酶
真核生物存在3种ATP依赖型DNA连接酶——DNA连接酶Ⅰ、DNA连接酶Ⅲ和DNA连接酶Ⅳ。研究显示,DNA连接酶Ⅰ和DNA连接酶Ⅳ广泛分布于真核生物中,如植物界和动物界,DNA连接酶Ⅲ则主要分布于脊椎动物中。
目前科学家认为,在真核生物DNA复制过程中,起到连接作用的可能主要是DNA连接酶Ⅰ,DNA连接酶Ⅰ活性的调节与其氨基端有关,在其氨基端靠近活性中心有一个特定的部位,该部位可以通过磷酸化作用来调节DNA连接酶Ⅰ的活性。DNA连接酶Ⅰ的作用就是将DNA复制时复制叉处形成的不连续的后随链(冈崎片段)连接起来。在此过程中DNA连接酶Ⅰ并不是单独起作用,而是需要和多种蛋白因子密切合作共同完成。在真核生物DNA复制时,后随链是由DNA聚合酶α催化合成的,DNA聚合酶α先催化合成一段引物,然后依赖DNA聚合酶δ与增殖细胞核抗原(持续复制因子),从引物开始合成DNA,然后引物通过降解出去。此外,在损伤的DNA的碱基修复中,DNA连接酶Ⅰ也同样起到重要的作用。首先细胞内的特异性的核酸内切酶和外切酶特异性识别损伤部位,在DNA单链损伤部位的附近进行剪切,切除一段DNA,然后DNA聚合酶以另一条完整的DNA链作为模版进行修复合成重新合成这段DNA,最后由DNA连接酶Ⅰ将缺口连接。
作者:毕合生物公众号:毕合生物以上内容由毕合生物(https://t.cn/A6Cqnjpn)提供服务内容:分子生物学、免疫, 重组蛋白及ELISA相关、活性小分子化合物、高端化学、材料化学、细胞资源库与培养相关、生命科学、天然产物
1、T4DNA连接酶
T4DNA连接酶是目前应用比较多的病毒基因组编码的DNA连接酶,在基因重组中广泛使用。噬菌体类型较多,目前研究发现T4噬菌体能够合成T4DNA连接酶,并且已经能够从被T4嗜菌体感染的大肠杆菌中提取该酶,此外科学家也已经定位该酶的合成基因,即噬菌体T4的30基因。T4DNA连接酶具有连接黏性末端和平末端的作用,研究人员总结DNA片段的连接过程,认为整个DNA连接反应可以通过三个连续步骤来完成:
(1)ATP通过断裂最后一个高能磷酸键释放能量,同时产生的AMP和T4DNA连接酶利用ATP水解释放的能量形成E-AMP复合物;
(2)所形成的E-AMP复合物可以识别DNA双链之前被切开的切口,识别之后AMP会脱离E-AMP复合物并与DNA的5’-P基团结合;
(3)需要连接的另外一段DNA分子片段的3’-OH会攻击第二步形成5’-P-AMP,3’-OH和磷酸基团残基发生反应形成磷酸二酯键,同时释放出一个AMP。
2、 真核生物DNA连接酶
真核生物存在3种ATP依赖型DNA连接酶——DNA连接酶Ⅰ、DNA连接酶Ⅲ和DNA连接酶Ⅳ。研究显示,DNA连接酶Ⅰ和DNA连接酶Ⅳ广泛分布于真核生物中,如植物界和动物界,DNA连接酶Ⅲ则主要分布于脊椎动物中。
目前科学家认为,在真核生物DNA复制过程中,起到连接作用的可能主要是DNA连接酶Ⅰ,DNA连接酶Ⅰ活性的调节与其氨基端有关,在其氨基端靠近活性中心有一个特定的部位,该部位可以通过磷酸化作用来调节DNA连接酶Ⅰ的活性。DNA连接酶Ⅰ的作用就是将DNA复制时复制叉处形成的不连续的后随链(冈崎片段)连接起来。在此过程中DNA连接酶Ⅰ并不是单独起作用,而是需要和多种蛋白因子密切合作共同完成。在真核生物DNA复制时,后随链是由DNA聚合酶α催化合成的,DNA聚合酶α先催化合成一段引物,然后依赖DNA聚合酶δ与增殖细胞核抗原(持续复制因子),从引物开始合成DNA,然后引物通过降解出去。此外,在损伤的DNA的碱基修复中,DNA连接酶Ⅰ也同样起到重要的作用。首先细胞内的特异性的核酸内切酶和外切酶特异性识别损伤部位,在DNA单链损伤部位的附近进行剪切,切除一段DNA,然后DNA聚合酶以另一条完整的DNA链作为模版进行修复合成重新合成这段DNA,最后由DNA连接酶Ⅰ将缺口连接。
作者:毕合生物公众号:毕合生物以上内容由毕合生物(https://t.cn/A6Cqnjpn)提供服务内容:分子生物学、免疫, 重组蛋白及ELISA相关、活性小分子化合物、高端化学、材料化学、细胞资源库与培养相关、生命科学、天然产物
这周末任务不少啊,只是糖酵解就让我有点懵了,更别提糖的有氧氧化。丙酮酸脱羧和柠檬酸循环看起来都好复杂。
让我来尝试不看课本说一下糖酵解过程。一分子葡糖糖在己糖激酶的作用下,消耗一分子ATP,被磷酸化为6-磷酸葡萄糖,6-磷酸葡萄糖在异构酶作用下转变为6-磷酸果糖,6-磷酸果糖在6-磷酸果糖激酶-1的作用下,消耗1分子ATP生成1,6-二磷酸果糖,1,6-二磷酸果糖分解生成磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛,磷酸二羟丙酮可异构转化为3-磷酸甘油醛,3-磷酸甘油醛在3-磷酸甘油醛脱氢酶的作用下,与Pi和NAD+生成含有高能磷酸键的1,3-二磷酸甘油酸,1,3-二磷酸甘油酸去磷酸化,高能磷酸键断裂,结合ADP生成ATP和3-磷酸甘油酸,3-磷酸甘油酸异构转化为2-磷酸甘油酸,2-磷酸甘油酸脱水生成含有高能磷酸键的磷酸烯醇式丙酮酸,磷酸烯醇式丙酮酸在丙酮酸激酶作用下去磷酸化,与ADP生成ATP和丙酮酸
让我来尝试不看课本说一下糖酵解过程。一分子葡糖糖在己糖激酶的作用下,消耗一分子ATP,被磷酸化为6-磷酸葡萄糖,6-磷酸葡萄糖在异构酶作用下转变为6-磷酸果糖,6-磷酸果糖在6-磷酸果糖激酶-1的作用下,消耗1分子ATP生成1,6-二磷酸果糖,1,6-二磷酸果糖分解生成磷酸二羟丙酮和3-磷酸甘油醛,磷酸二羟丙酮可异构转化为3-磷酸甘油醛,3-磷酸甘油醛在3-磷酸甘油醛脱氢酶的作用下,与Pi和NAD+生成含有高能磷酸键的1,3-二磷酸甘油酸,1,3-二磷酸甘油酸去磷酸化,高能磷酸键断裂,结合ADP生成ATP和3-磷酸甘油酸,3-磷酸甘油酸异构转化为2-磷酸甘油酸,2-磷酸甘油酸脱水生成含有高能磷酸键的磷酸烯醇式丙酮酸,磷酸烯醇式丙酮酸在丙酮酸激酶作用下去磷酸化,与ADP生成ATP和丙酮酸
防晒措施中容易被忽视的存在——防蓝光
蓝光损伤近几年得到越来越多的重视。随着化妆品行业越来越卷众多品牌都在寻求差异化突破,以及大家对皮肤护理的日益精致,我们有必要将蓝光防护提到日常上来了。
▍蓝光是什么?
通常我们说的防晒是防紫外线,尤其是UVB和UVA,其波长在280-400nm之间,蓝光波长通常定义在400-500nm之间(图1),且穿透皮肤更深,大多数紫外防晒剂达不到蓝光防护的目的。
另外有些研究将400-450nm的蓝光波段称为高能可见光,在皮尔法伯的研究中蓝光效率虽然只有UVA的1/4,但蓝光剂量是UVA的两倍多,所以认为蓝光损伤的力度可达UVA损伤的一半左右,可见蓝光损伤也是不可忽视的。当前大家都非常重视紫外线尤其是UVA损伤,那精致的我们肯定要对蓝光损伤有更进一步的了解。
▍蓝光损伤
蓝光损伤主要会导致皮肤老化、色沉、皮肤昼夜节律失衡、皮肤干燥等问题。
◆皮肤老化:蓝光会诱导ROS过量生成,ROS进一步激活MAPK、AP-1、NF-κB等炎症相关信号通路,从而促进MMPs的表达造成胶原降解。
◆皮肤色沉:蓝光激活视蛋白3(Opsin3)引发钙离子相关信号通路被激活,导致MITF磷酸化,上调黑色素相关蛋白表达。亚洲人似乎对蓝光导致的色沉更加敏感。
◆昼夜节律失衡、皮肤干燥:蓝光通过影响褪黑素信号导致昼夜节律失衡;同时抑制水通道蛋白表达导致皮肤干燥等问题。
▍防蓝光措施
先说一下,太阳来源的蓝光损伤研究得比较多,而人工光源比如电脑手机灯管等蓝光光源的影响则许多文献中语焉不详,其强度比太阳来源的低2-3个数量级,目前我们可以不用考虑。不过现在的上班族每天有十多个小时暴露在屏幕蓝光下,其长期积累会不会对我们有影响也未可知。
防蓝光常见成分:
◆烟酰胺、叶黄素、肌肽等,产品中很常见到,防晒中添加烟酰胺是好选择;
◆氧化铁类,可吸收蓝光,润色防晒中常用到,日常可选择润色防晒对蓝光防护更全;
◆大颗粒的二氧化钛、云母、天莱施M等可通过反射或散射蓝光,降低蓝光的透过。
各集团近期研究
◆雅漾:新型防晒剂TriAsorB,吸收反射双重特性。相比常见的防晒剂,其在蓝光波段具有明显优势,并有一定的反射可见光能力。
◆资生堂:验证蓝光诱导的脂质过氧化和UVA类似,但发现蓝光诱导的氧化反应可能与UVA诱导的氧化反应机制并不同,并发现亚牛磺酸和硫代牛磺酸对蓝光诱导的脂质过氧化具有特异性(其抑制蓝光诱导的氧化作用比UVA诱导的更有效)。
◆雅诗兰黛:开发薰衣草提取物,快速清除蓝光导致的自由基,小棕瓶眼霜的升级点。
另外还有一些原料,我直接贴出来了放在图3,懒得翻译了感兴趣的小伙伴可以根据商品名自己去搜搜看~
蓝光损伤近几年得到越来越多的重视。随着化妆品行业越来越卷众多品牌都在寻求差异化突破,以及大家对皮肤护理的日益精致,我们有必要将蓝光防护提到日常上来了。
▍蓝光是什么?
通常我们说的防晒是防紫外线,尤其是UVB和UVA,其波长在280-400nm之间,蓝光波长通常定义在400-500nm之间(图1),且穿透皮肤更深,大多数紫外防晒剂达不到蓝光防护的目的。
另外有些研究将400-450nm的蓝光波段称为高能可见光,在皮尔法伯的研究中蓝光效率虽然只有UVA的1/4,但蓝光剂量是UVA的两倍多,所以认为蓝光损伤的力度可达UVA损伤的一半左右,可见蓝光损伤也是不可忽视的。当前大家都非常重视紫外线尤其是UVA损伤,那精致的我们肯定要对蓝光损伤有更进一步的了解。
▍蓝光损伤
蓝光损伤主要会导致皮肤老化、色沉、皮肤昼夜节律失衡、皮肤干燥等问题。
◆皮肤老化:蓝光会诱导ROS过量生成,ROS进一步激活MAPK、AP-1、NF-κB等炎症相关信号通路,从而促进MMPs的表达造成胶原降解。
◆皮肤色沉:蓝光激活视蛋白3(Opsin3)引发钙离子相关信号通路被激活,导致MITF磷酸化,上调黑色素相关蛋白表达。亚洲人似乎对蓝光导致的色沉更加敏感。
◆昼夜节律失衡、皮肤干燥:蓝光通过影响褪黑素信号导致昼夜节律失衡;同时抑制水通道蛋白表达导致皮肤干燥等问题。
▍防蓝光措施
先说一下,太阳来源的蓝光损伤研究得比较多,而人工光源比如电脑手机灯管等蓝光光源的影响则许多文献中语焉不详,其强度比太阳来源的低2-3个数量级,目前我们可以不用考虑。不过现在的上班族每天有十多个小时暴露在屏幕蓝光下,其长期积累会不会对我们有影响也未可知。
防蓝光常见成分:
◆烟酰胺、叶黄素、肌肽等,产品中很常见到,防晒中添加烟酰胺是好选择;
◆氧化铁类,可吸收蓝光,润色防晒中常用到,日常可选择润色防晒对蓝光防护更全;
◆大颗粒的二氧化钛、云母、天莱施M等可通过反射或散射蓝光,降低蓝光的透过。
各集团近期研究
◆雅漾:新型防晒剂TriAsorB,吸收反射双重特性。相比常见的防晒剂,其在蓝光波段具有明显优势,并有一定的反射可见光能力。
◆资生堂:验证蓝光诱导的脂质过氧化和UVA类似,但发现蓝光诱导的氧化反应可能与UVA诱导的氧化反应机制并不同,并发现亚牛磺酸和硫代牛磺酸对蓝光诱导的脂质过氧化具有特异性(其抑制蓝光诱导的氧化作用比UVA诱导的更有效)。
◆雅诗兰黛:开发薰衣草提取物,快速清除蓝光导致的自由基,小棕瓶眼霜的升级点。
另外还有一些原料,我直接贴出来了放在图3,懒得翻译了感兴趣的小伙伴可以根据商品名自己去搜搜看~
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